Marcin Buczkowski był ekonomistą, absolwentem Wyższej Szkoły Zarządzania w Warszawie oraz studiów MBA Thames Valley University, które ukończył w 2000 r.
Karierę zawodową rozpoczął jeszcze w czasie studiów, w 1996 r. w Departamencie Instytucji Finansowych w warszawskiej centrali PKO BP. W wieku 21 lat objął swoje pierwsze stanowisko dyrektorskie – został dyrektorem Biura Operacji Kapitałowych firmy KBU Protektor.
W 2001 r. trafił do Nafty Polskiej, państwowej firmy, która została stworzona m.in. po to, by zarządzać i prywatyzować polską branżę chemiczną oraz paliwową. Będąc doradcą w Biurze Polityki Finansowej NP, został czółkiem rady nadzorczej Rafinerii Czechowice.
Z Naftą Polską rozstał się trzy lata później. Od 1 lipca 2003 r. pełnił funkcję członka zarządu Zakładów Azotowych Puławy. Odpowiadając za finanse tej spółki, brał czynny udział w przygotowaniach do jej giełdowego debiutu. Puławy trafiły na GPW 19 października 2005 r.
Gdy w połowie lutego 2006 r. ówczesny prezes Puław Zygmunt Kwiatkowski został odwołany, Buczkowski stanął na czele zakładów. Był ich prezesem od kwietnia do sierpnia 2006 r. W październiku 2006., niemal rok po giełdowym debiucie Puław, Buczkowski zrezygnował z zasiadania w zarządzie zakładów.
