W pierwszym roku członkostwa Polski w Unii Europejskiej (UE) płatności z budżetu państwa niezbędne do wyrównania docelowego poziomu dopłat 55%, 60% i 65% mogą maksymalnie wynieść 1,881 mld zł, w drugim - 2,088 mld zł, a w trzecim - 2,358 mld zł.
W sumie finansowanie z budżetu dopłat bezpośrednich może w latach 2004-2006 pochłonąć 6,327 mld zł. Tylko z budżetu UE (w ramach realizacji Wspólnej Polityki Rolnej - WPR) na dopłaty bezpośrednie Polska otrzyma w tym okresie ok. 7,252 mld euro.
Ostatecznie wynegocjowano płatności bezpośrednie w latach 2004-2006 na poziomie 55%, 60% i 65% poziomu stawek unijnych. Płatności mają się składać z 25%, 30% i 35% płatności bezpośrednich finansowanych z funduszy unijnych WPR oraz przesunięcia części środków z funduszy na rozwój obszarów wiejskich, co pozwoli na podniesienie płatności w wymienionych latach do wysokości 36%, 39% i 42% poziomu docelowego.
Dalsze podwyższenie płatności bezpośrednich do wyżej wskazanych limitów (czyli 55%, 60%, 65%) może też nastąpić wskutek wsparcia krajowego, szacowanego maksymalnie przez FAPA na 6,237 mld zł.
Jednak już wcześniej zarówno Premier Leszek Miller, jak i minister finansów mówili, że wsparcie dopłat bezpośrednich przez budżet państwa będzie zależało od stanu finansów publicznych. A obecnie reforma finansów publicznych wydaje się wyjątkowo konieczna wskutek wysokich kosztów budżetowych (szacowanych na kilka miliardów złotych) po przystąpieniu Polski do struktur unijnych w maju 2004 roku. Sama składka do budżetu unijnego wyniesie ok. 2,5 mld euro rocznie przy kompensatach budżetowych z UE na poziomie ok. 500 mln euro rocznie.
