Stopyra został powołany 25 marca 2004 r. na wniosek ówczesnego prezesa Leszka Balcerowicza.
W tym samym czasie do zarządu banku centralnego zostali powołani wiceprezesi: Jerzy Pruski i Krzysztof Rybiński, którzy zdecydowali się odejść z banku centralnego na początku 2008 r.
Jerzy Stopyra to jeden z weteranów banku centralnego. W NBP pracuje od 1986 r. W 1991 r. został dyrektorem Departamentu Polityki Pieniężno-Kredytowej (obecnie Operacji Krajowych) – jednej z kluczowych komórek w banku centralnym. Rok później znalazł się w zarządzie NBP. W latach 1998–2004 był pierwszym zastępcą prezesa banku centralnego.
Wówczas członków zarządu powoływano i odwoływano na wniosek szefa banku centralnego. Mogło do tego dojść w dowolnym momencie. Pod koniec 2003 r. ustawa o Narodowym Banku Polskim została znowelizowana w taki sposób, że członkowie zarządu są powoływani na sześć lat. Podobnie jak prezes czy członkowie Rady Polityki Pieniężnej są właściwie nieodwoływalni.
Mimo formalnie mocnej pozycji członków zarządu w ścisłym kierownictwie banku centralnego nie ma już ani jednej osoby, która byłaby powołana na wniosek Leszka Balcerowicza. Po odejściu Jerzego Stopyry obecny prezes Sławomir Skrzypek może powołać do zarządu dwie nowe osoby. NBP nie odpowiedział na nasze pytanie, czy Jerzy Stopyra pozostanie w banku centralnym.
