Centrum Transportu Zrównoważonego zarzuca PKP Polskie Linie Kolejowe - spółce zajmującej się utrzymaniem infrastruktury kolejowej - prowadzenie złej polityki inwestycyjnej, która nie przynosi poprawy jakości ruchu kolejowego. W swoim raporcie eksperci centrum podkreślają, że większość najważniejszych inwestycji w infrastrukturę kolejową, przeprowadzonych w ostatnich latach, jest "nieefektywna i ekonomicznie nieuzasadniona". Jako przykład podają remont linii kolejowych na odcinku Mińsk Mazowiecki-Siedlce i Brzeg-Opole. Według nich, po zakończeniu prac, pociągi osobowe potrzebowały więcej czasu na pokonanie tych tras niż przed remontem. A obie inwestycje kosztowały kolej ponad 880 mln zł.
Centrum krytykuje również politykę remontową spółki. Ocenia, że większość środków nie jest kierowana na prace zmierzające do skrócenia czasu przejazdów pociągów, tylko na "kosztowne gadżety", niepoprawiające konkurencyjności kolei wobec innych środków transportu.
Autorzy raportu wskazują także na zły dobór kolejności inwestycji. Według nich, kolejarze remontują te odcinki, na których prowadzenie prac jest łatwiejsze. Wolą także modernizować linie kolejowe, prowadzące do granic kraju niż łączące największe miasta. Skutkuje to tym, że np. połączenie kolejowe między Krakowem a Katowicami jest w złym stanie (średnia prędkość pociągu Intercity na tym odcinku wynosi ok. 60 km/godz.), przez co kolej traci pasażerów na korzyść ruchu samochodowego (oba miasta łączy autostrada).
Krzysztof Łańcucki, rzecznik PKP PLK, ocenia, że metodologia, którą przyjęło centrum, jest "dość egzotyczna". - Nie uwzględnia potrzeb ruchu towarowego, który stanowi połowę przychodów spółki - mówi. Według niego, z tego powodu kolej remontuje linie kolejowe prowadzące do granic Polski, bo istnieje zapotrzebowanie na ruch tranzytowy. Według niego, braku poprawy w czasie jazdy pociągów nie należy upatrywać w złej jakości prac modernizacyjnych, ale w braku dostatecznie szybkich lokomotyw u przewoźników. Podkreśla, że ta sytuacja będzie poprawiała się w miarę wymiany taboru kolejowego.
